RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 E9PQ18 207 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLCO1B7G3V0H7 640 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTCAO00442 366 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNX3O60493 162 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRAF2O60831 178 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS6KA5O75582 802 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 NXPH2O95156 264 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHEP01854 428 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM86B2P0C5J1 330 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 STAG3L1P0CL83 205 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 GP1BBP13224 206 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 F3P13726 295 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 ERCC2P18074 760 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKCIP41743 596 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPY4RP50391 375 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTCP1P56278 107 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF273Q14593 569 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAZQ16635 292 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTGISQ16647 500 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNAI3Q3KNW1 292 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 BSPRYQ5W0U4 402 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 CYB5D1Q6P9G0 228 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTR9Q6PD62 1173 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM47EQ6ZV65 393 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 C5orf24Q7Z6I8 188 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFAF2Q8N183 169 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 AQP11Q8NBQ7 271 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR6S1Q8NH40 331 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP8B4Q8TF62 1192 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PIK3R3Q92569 461 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 NSMAFQ92636 917 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLCO2A1Q92959 643 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PYCR2Q96C36 320 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 OMA1Q96E52 524 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 NEDD4LQ96PU5 975 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPAG5Q96R06 1193 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 LPAR4Q99677 370 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 THEGQ9P2T0 379 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 GIMAP2Q9UG22 337 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF215Q9Y6U7 377 aa1.84□□□□□ -2.11
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCNX3Q9H6A9 2034 aa1.84□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOTCH3Q9UM47 2321 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV24A0A0B4J272 114 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPY2A6NKD2 308 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 C17orf105B2RV13 164 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 G3V2L1 256 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3BMM5 538 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TEX28O15482 410 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 PI15O43692 258 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 ECE2O60344 883 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 VTNP04004 478 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC175P0C221 793 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPY3P0CV98 308 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPY8P0CW00 308 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF224P0DH78 156 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 SELEP16581 610 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKACGP22612 351 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 HNF4AP41235 474 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR3A2P47893 321 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAF6P49848 677 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP10-5P60370 271 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 BTG1P62324 171 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 DLK1P80370 383 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYL7Q01449 175 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TSPY1Q01534 308 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 GUCY2DQ02846 1103 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CALCOCO2Q13137 446 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CDH18Q13634 790 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 OPCMLQ14982 345 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPN14Q15678 1187 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM189A2Q15884 450 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCP11X2Q5H9J9 407 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CES4AQ5XG92 561 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF613Q6PF04 617 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAT1Q6PIZ9 186 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 DOK6Q6PKX4 331 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 MOXD1Q6UVY6 613 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC24A5Q71RS6 500 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 CHST3Q7LGC8 479 aa1.83□□□□□ -2.12
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms