RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM86B1E9PN63 330 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 H0YAE9 185 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC30A4O14863 429 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZG16O60844 167 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCGR3BO75015 233 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SEC24AO95486 1093 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 VIMP08670 466 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM86B2P0C5J1 330 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 F3P13726 295 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPORP19235 508 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMB4P28070 264 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALDH1B1P30837 517 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP12AP54707 1039 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYL7Q01449 175 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMP22Q01453 160 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SULT2A1Q06520 285 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 OPCMLQ14982 345 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RBBP7Q16576 425 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF74Q16587 644 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRRC73Q5JTD7 316 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEP85LQ5SZL2 805 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LEKR1Q6ZMV7 388 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM47EQ6ZV65 393 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTN2A1Q7KYR7 527 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMIGO1Q86WK6 493 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 HCAR2Q8TDS4 363 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CORO2AQ92828 525 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL5Q96PQ7 755 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 INTS14Q96SY0 518 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 LPAR4Q99677 370 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADPGKQ9BRR6 497 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR13Q9H1Z4 485 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNX25Q9H3E2 840 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 BARHL2Q9NY43 387 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKD2L2Q9NZM6 624 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM4Q9UKN5 801 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTF3C4Q9UKN8 822 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNK7Q9Y2U2 307 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.34□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF26BQ2KJY2 2108 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV34A0A0B4J273 112 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGEF37A1IGU5 675 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C15orf61A6NNL5 157 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C17orf105B2RV13 164 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCL24O00175 119 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TEX28O15482 410 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 FLRT2O43155 660 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PGLSO95336 258 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C9P02748 559 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 RNF224P0DH78 156 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SP100P23497 879 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT2P35908 639 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNA2P51530 1060 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN14Q15678 1187 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYB5D1Q6P9G0 228 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CTR9Q6PD62 1173 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PET117Q6UWS5 81 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTNL8Q6UX41 500 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPR141Q7Z602 305 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOGA1Q86XE5 327 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TICAM2Q86XR7 235 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR8H3Q8N146 312 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPC2Q8N158 579 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHDC1Q8N7A1 406 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC37A3Q8NCC5 494 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP45Q92619 1136 aa2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms