RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 URADA6NGE7 173 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C9J4A7 227 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 H7BY64 318 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR47O94967 919 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RECKO95980 971 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A12P48065 614 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GABRA4P48169 554 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PGGT1BP53609 377 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NAA20P61599 178 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CDC16Q13042 620 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CLN3Q13286 438 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MUM1Q2TAK8 710 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PAGE2BQ5JRK9 111 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RHBDD2Q6NTF9 364 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SPATA6LQ8N4H0 392 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NKD1Q969G9 470 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UBE2E3Q969T4 207 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PTERQ96BW5 349 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC126Q96EE4 140 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MVB12AQ96EY5 273 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF285Q96NJ3 590 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DCBLD2Q96PD2 775 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ATOH8Q96SQ7 321 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NRTNQ99748 197 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SARGQ9BW04 601 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CD244Q9BZW8 370 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC6A20Q9NP91 592 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 OPTCQ9UBM4 332 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MID2Q9UJV3 735 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A14Q9Y267 594 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A0J9YVX5 310 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TRBC2A0A5B9 178 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FITM1A5D6W6 292 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 KRT87PA6NCN2 255 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 K7EPI3 171 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MEN1O00255 615 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP2K7O14733 419 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF749O43361 778 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GLRA3O75311 464 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GCAP28676 217 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DLG1Q12959 904 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4D1Q15615 310 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PDK4Q16654 411 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 WASHC2DQ5SRD0 308 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXO42Q6P3S6 717 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC81Q6ZN84 652 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TRPV3Q8NET8 790 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4K1Q8NGD4 311 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UBTD2Q8WUN7 234 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PYCR2Q96C36 320 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 EFCAB11Q9BUY7 163 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM109Q9BVC6 243 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 LHX9Q9NQ69 397 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR70Q9NW82 654 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SENP1Q9P0U3 644 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TBK1Q9UHD2 729 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GRID1Q9ULK0 1009 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PADI2Q9Y2J8 665 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ACACBO00763 2458 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A1B0GX78 115 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TLDC2A0PJX2 215 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STX16O14662 325 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RFPL1O75677 317 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NTRK1P04629 796 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB40ALP0C0E4 278 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH1P12830 882 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 EPB42P16452 691 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SERPINB1P30740 379 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 AHRP35869 848 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STAT5AP42229 794 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK1G2P78368 415 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DCDP81605 110 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CCDC153Q494R4 210 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TECRLQ5HYJ1 363 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC22A9Q8IVM8 553 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM20CQ8IXL6 584 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DSELQ8IZU8 1212 aa13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms