RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 IPMKQ8NFU5 416 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 HGH1Q9BTY7 390 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 NT5DC2Q9H857 520 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 ARFGAP3Q9NP61 516 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 HEY1Q9Y5J3 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-210ENST00000503258 ISM1B1AKI9 464 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 C19orf84I3L1E1 186 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 SMAPO00193 183 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-210ENST00000503258 GAS8O95995 478 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 OR4K1Q8NGD4 311 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-210ENST00000503258 ZNF559Q9BR84 538 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 TREX1Q9NSU2 369 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 JKAMPQ9P055 326 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 MAP10Q9P2G4 905 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-210ENST00000503258 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-210ENST00000503258 ESR1P03372 595 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 POLBP06746 335 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 SKILP12757 684 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 GABRA1P14867 456 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 MAGP20916 626 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 DNASE1P24855 282 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CCR7P32248 378 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CHRNA4P43681 627 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 NPY2RP49146 381 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 NPNTQ6UXI9 565 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ANKRD7Q92527 254 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ZFP3Q96NJ6 502 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CYTH2Q99418 400 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LANCL2Q9NS86 450 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 CTAG2O75638 210 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PIRTP0C851 137 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 OR1C1Q15619 314 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 LCTLQ6UWM7 567 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 AMFRQ9UKV5 643 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 SLC26A5P58743 744 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 HERC3Q15034 1050 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 HSPB2Q16082 182 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 NHSL2Q5HYW2 709 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa7.26□□□□□ -1.25
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PDE4D-210ENST00000503258 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-210ENST00000503258 OR13C4Q8NGS5 318 aa7.26□□□□□ -1.25
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