RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	DHODH	Q02127	395 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PRKG2	Q13237	762 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZNF146	Q15072	292 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	GPR33	Q49SQ1	333 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SPATA1	Q5VX52	437 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RAPH1	Q70E73	1250 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	LGI2	Q8N0V4	545 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NYX	Q9GZU5	481 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		2.62	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	AGAP14	A8MT82	685 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ECE2	O60344	883 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	GP1BB	P13224	206 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SAT1	P21673	171 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CD27	P26842	260 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DRD3	P35462	400 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NRIP1	P48552	1158 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	LMAN1	P49257	510 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DNA2	P51530	1060 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CDH13	P55290	713 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	HNRNPK	P61978	463 aa	Known RBP eCLIP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	IGSF11	Q5DX21	431 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RAB41	Q5JT25	222 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CFAP161	Q6P656	301 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	POC5	Q8NA72	575 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		2.61	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	AHCYL1	O43865	530 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	IGHV2-70	P01814	119 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PRKAR1A	P10644	381 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DNASE1	P24855	282 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PTGER4	P35408	488 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PSMC6	P62333	389 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	EXD1	Q8NHP7	514 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NSMAF	Q92636	917 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	SPDL1	Q96EA4	605 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MXD3	Q9BW11	206 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	OPA3	Q9H6K4	179 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ARPC2	O15144	300 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	BEST1	O76090	585 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	STARD3NL	O95772	234 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	THY1	P04216	161 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	DANCR	P0C864	163 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	AOC1	P19801	751 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	ALDH1B1	P30837	517 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	HLCS	P50747	726 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	LYZ	P61626	148 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	EPS8	Q12929	822 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	STK4	Q13043	487 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	CFAP58	Q5T655	872 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	KBTBD6	Q86V97	674 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	MCU	Q8NE86	351 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	APPL2	Q8NEU8	664 aa		2.59	□□□□□ -1.99
USP34-222	ENST00000498268	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		2.59	□□□□□ -1.99

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