RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 IPO13O94829 963 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 EZRP15311 586 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R7Q15435 360 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 TUBB8Q3ZCM7 444 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 VWA2Q5GFL6 755 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ATG9BQ674R7 924 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 MVB12AQ96EY5 273 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 NDNQ99608 321 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CRB3Q9BUF7 120 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 USP27XA6NNY8 438 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 HAT1O14929 419 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ZBTB14O43829 449 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 KLHL41O60662 606 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 VPS26AO75436 327 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CCNDBP1O95273 360 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ITGA3P26006 1051 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 SLC26A3P40879 764 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 ABATP80404 500 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 DSG2Q14126 1118 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 RBBP7Q16576 425 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CUZD1Q86UP6 607 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 PLD3Q8IV08 490 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 CABS1Q96KC9 395 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 NTNG1Q9Y2I2 539 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQ72 361 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SYF2O95926 243 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 FBLP22087 321 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 EFNA3P52797 238 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CDKN2DP55273 166 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 IQCKQ8N0W5 287 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MIEF2Q96C03 454 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ASF1BQ9NVP2 202 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SLC17A6Q9P2U8 582 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ASIC3Q9UHC3 531 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SH2B3Q9UQQ2 575 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PDE10AQ9Y233 779 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa26.45■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZGRF1Q86YA3 2104 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 POLEQ07864 2286 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 BLACEA4D250 179 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 FFAR3O14843 346 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 GPR42O15529 346 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SEMA7AO75326 666 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 AHSGP02765 367 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 RNF224P0DH78 156 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 OCA2Q04671 838 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SPANXN3Q5MJ09 141 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 GARNL3Q5VVW2 1013 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 VN1R4Q7Z5H5 301 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PARP9Q8IXQ6 854 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PRSS58Q8IYP2 241 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 C8orf44Q96CB5 159 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PWWP2AQ96N64 755 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 C3orf18Q9UK00 162 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 H7BY64 318 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TP73O15350 636 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TTC4O95801 387 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TSPAN12O95859 305 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 GP1BBP13224 206 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TCP1P17987 556 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CARSP49589 748 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TBPL1P62380 186 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 HIF1AQ16665 826 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PAQR3Q6TCH7 311 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 GALNT7Q86SF2 657 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SHISA5Q8N114 240 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PRAP1Q96NZ9 151 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TGIF2Q9GZN2 237 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 LHPPQ9H008 270 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ABCF3Q9NUQ8 709 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 SVILO95425 2214 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 HPP00738 406 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 COX6A1P12074 109 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 VARSP26640 1264 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CREG2Q8IUH2 290 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ZADH2Q8N4Q0 377 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PPP4R1Q8TF05 950 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 TM9SF4Q92544 642 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CERS2Q96G23 380 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 NAT9Q9BTE0 207 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CDC14AQ9UNH5 594 aa26.42■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 IDSB3KWA1 339 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 CBX6O95503 412 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 ACPPP15309 386 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PGGT1BP53609 377 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 FAM53BQ14153 422 aa26.41■■□□□ 1.82
HOXB3-211ENST00000490677 PHKG1Q16816 387 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms