RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SLC5A11Q8WWX8 675 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PYCR2Q96C36 320 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 REPS1Q96D71 796 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FAR2Q96K12 515 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C7orf26Q96N11 449 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CCT7Q99832 543 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NT5DC2Q9H857 520 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C1GALT1Q9NS00 363 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 DKK4Q9UBT3 224 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRPS1Q9UHF7 1281 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 POMT2Q9UKY4 750 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 A0A0J9YY10 115 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CPED1A4D0V7 1026 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GSAPA4D1B5 854 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TLCD2A6NGC4 264 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 B4GAT1O43505 415 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CPNE6O95741 557 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C9P02748 559 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 UGT2B7P16662 529 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GRK3P35626 688 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CCR8P51685 355 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 IRF8Q02556 426 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 BST1Q10588 318 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RBBP7Q16576 425 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GUSBP11Q6P575 273 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 NXPE4Q6UWF7 544 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SUSD1Q6UWL2 747 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MILR1Q7Z6M3 343 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZNF605Q86T29 641 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TTLQ8NG68 377 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 IFI44Q8TCB0 444 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 THAP11Q96EK4 314 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR2A14Q96R47 310 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR4K3Q96R72 315 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CCDC3Q9BQI4 270 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SARGQ9BW04 601 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SLC29A3Q9BZD2 475 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SEMA6CQ9H3T2 930 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ACTR8Q9H981 624 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZBTB26Q9HCK0 441 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 SEMA5BQ9P283 1151 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CIDEBQ9UHD4 219 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TAC3Q9UHF0 121 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 KALRNO60229 2985 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 A0A087WV48 116 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 H0YIV9 168 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR7A17O14581 309 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 WFS1O76024 890 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TGDSO95455 350 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CHEK2O96017 543 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 UROSP10746 265 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 HGFP14210 728 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 JUPP14923 745 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 EZRP15311 586 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ITPKBP27987 946 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CD1CP29017 333 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CDH13P55290 713 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR1D5P58170 312 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OCRLQ01968 901 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GUCY1A3Q02108 690 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CHIT1Q13231 466 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CAMK2BQ13554 666 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 XKR6Q5GH73 641 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 DHRS13Q6UX07 377 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 PRSS42Q7Z5A4 293 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 CLYBLQ8N0X4 340 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 OR4D9Q8NGE8 314 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-211ENST00000488243 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms