RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 CCDC166P0CW27 439 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CD1DP15813 335 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CDKL1Q00532 357 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NFKB2Q00653 900 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 LY6DQ14210 128 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 NCF4Q15080 339 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PRTGQ2VWP7 1150 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 DEFB109BQ30KR1 87 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 FAM214AQ32MH5 1076 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 BORAQ6PGQ7 559 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ADCK2Q7Z695 626 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 SYVN1Q86TM6 617 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 PLD3Q8IV08 490 aa20.02■□□□□ 0.8
ACTB-211ENST00000480301 OR4K3Q96R72 315 aa20.02■□□□□ 0.8
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ACTB-211ENST00000480301 SLC35E2BP0CK96 405 aa20■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 ATP6V0D1P61421 351 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 DLG1Q12959 904 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 BMPR2Q13873 1038 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CSHL1Q14406 222 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC9A5Q14940 896 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 MROH9Q5TGP6 573 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 DTWD1Q8N5C7 304 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 PTERQ96BW5 349 aa20■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 C17orf62Q9BQA9 187 aa20■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.99■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 ABHD11Q8NFV4 315 aa19.99■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 CCR10P46092 362 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 KCNC1P48547 511 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 HNMTP50135 292 aa19.98■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 COX15Q7KZN9 410 aa19.98■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 OR4K1Q8NGD4 311 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 SLC44A1Q8WWI5 657 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 KIAA1191Q96A73 305 aa19.98■□□□□ 0.79
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ACTB-211ENST00000480301 EGFL8Q99944 293 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 KCNMB2Q9Y691 235 aa19.98■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
ACTB-211ENST00000480301 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
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