RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 OR52K2Q8NGK3 314 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.45□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HTRA1Q92743 480 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 STARP49675 285 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.45□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SLC22A12Q96S37 553 aa7.45□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 GPR21Q99679 349 aa7.45□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 ORC5O43913 435 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 CER1O95813 267 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 WNT16Q9UBV4 365 aa7.45□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 FAR1Q8WVX9 515 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 LCN9Q8WX39 176 aa7.44□□□□□ -1.22
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USP54-210ENST00000466048 DPY30Q9C005 99 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TMEM45AQ9NWC5 275 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 DHRS7Q9Y394 339 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ISPDA4D126 451 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 RGS14O43566 566 aa7.44□□□□□ -1.22
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