RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 GFERP55789 205 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ERVPABLB-1P60509 514 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GNGT1P63211 74 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CSNK1G2P78368 415 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OCRLQ01968 901 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SPIDRQ14159 915 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 DOC2AQ14183 400 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 METTL6Q8TCB7 284 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT22Q9BRQ3 303 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PFDN4Q9NQP4 134 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 SEMA5BQ9P283 1151 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PDP2Q9P2J9 529 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 TRAF6Q9Y4K3 522 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 SLC30A4O14863 429 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD34CP0C6C1 535 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 ARL4DP49703 201 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1CAP62136 330 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 PHEXP78562 749 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CES4AQ5XG92 561 aa9.02□□□□□ -0.97
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SH3BP4-208ENST00000462602 PAQR7Q86WK9 346 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CDYL2Q8N8U2 506 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB124Q8NES8 71 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
SH3BP4-208ENST00000462602 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.02□□□□□ -0.97
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