RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 PHF2O75151 1096 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PAX1P15863 534 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF24P17028 368 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 IDUAP35475 653 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 DDIT3P35638 169 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ACVR1BP36896 505 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CAPZBP47756 277 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ASCL1P50553 236 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 SCNN1BP51168 640 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 LGALS4P56470 323 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 HSD11B2P80365 405 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 VLDLRP98155 873 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MLC1Q15049 377 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CARD16Q5EG05 197 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 C1orf189Q5VU69 101 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 BSPRYQ5W0U4 402 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 DOK6Q6PKX4 331 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 OR8K5Q8NH50 307 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 SVIPQ8NHG7 77 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TEKT4Q8WW24 435 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CYFIP2Q96F07 1278 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 C17orf62Q9BQA9 187 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 HES7Q9BYE0 225 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ULBP1Q9BZM6 244 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PPCSQ9HAB8 311 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 FANCEQ9HB96 536 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB6Q9NWX5 421 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPRE3Q9UPY8 281 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CDYLQ9Y232 598 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 F5H5T6 163 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CCER2I3L3R5 266 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 STX6O43752 255 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 USP1O94782 785 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 GPANK1O95872 356 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBED1O96006 694 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 LPLP06858 475 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MMP11P24347 488 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 SRP14P37108 136 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TKTL1P51854 596 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ITKQ08881 620 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 POSTNQ15063 836 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ETFDHQ16134 617 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 GFOD2Q3B7J2 385 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 GPRC6AQ5T6X5 926 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM166AQ6J272 317 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 IYDQ6PHW0 289 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PELI3Q8N2H9 469 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MYCT1Q8N699 235 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 BANPQ8N9N5 519 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA1191Q96A73 305 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 HMCESQ96FZ2 354 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF778Q96MU6 729 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 OR2M4Q96R27 311 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMB7Q99436 277 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TTYH2Q9BSA4 534 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TLR10Q9BXR5 811 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 MMP27Q9H306 513 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 KCTD10Q9H3F6 313 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 POT1Q9NUX5 634 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 PSD3Q9NYI0 1048 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 B4GALT7Q9UBV7 327 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 OR51B4Q9Y5P0 310 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 STYXL1Q9Y6J8 313 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms