RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A0J9YVX5	310 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLD2	O14939	933 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NEFH	P12036	1026 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TSPAN8	P19075	237 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALDH3A1	P30838	453 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAGLU	P54802	743 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDH13	P55290	713 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRF8	Q02556	426 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CYP4F3	Q08477	520 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TUBB3	Q13509	450 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCLAF	Q15004	111 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBBP7	Q16576	425 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HHAT	Q5VTY9	493 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF21	Q9NSA1	209 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAT1	O14929	419 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR1F1	O43749	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRIM13	O60858	407 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTSV	O60911	334 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNG1	P51959	295 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSNK1G2	P78368	415 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACY1	Q03154	408 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLC	Q05315	142 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASPH	Q12797	758 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPS2	Q13227	327 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHIT1	Q13231	466 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNC50	Q53HI1	259 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF425	Q6IV72	752 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CTRC	Q99895	268 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTPRB	P23467	1997 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HCRTR1	O43613	425 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BPGM	P07738	259 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPOR	P19235	508 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CXCR2	P25025	360 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ETV4	P43268	484 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERPINB4	P48594	390 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJB13	P59910	316 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GABRE	P78334	506 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MC2R	Q01718	297 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DOC2A	Q14183	400 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATG9B	Q674R7	924 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDK15	Q96Q40	435 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	APMAP	Q9HDC9	416 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RARRES3	Q9UL19	164 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	AK5	Q9Y6K8	562 aa		13.13	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms