RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TFEBP19484 476 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFS1P28331 727 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CCR7P32248 378 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EIF1P41567 113 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 P2RY4P51582 365 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G16P53816 162 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 WDR4P57081 412 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF91Q05481 1191 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGEF7Q14155 803 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM5Q6NVV9 412 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LYPD8Q6UX82 237 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KCTD1Q719H9 257 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 C14orf79Q96F83 325 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 KCNJ15Q99712 375 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 TASP1Q9H6P5 420 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CDHR5Q9HBB8 845 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TREM2Q9NZC2 230 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LIMD1Q9UGP4 676 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NENFQ9UMX5 172 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RNF6Q9Y252 685 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR10H1Q9Y4A9 318 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CBX4O00257 560 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CHRNB2P17787 502 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KCNH2Q12809 1159 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GAS6Q14393 721 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFA9Q16795 377 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 BEX5Q5H9J7 111 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CUZD1Q86UP6 607 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FAM26EQ8N5C1 309 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM104Q8NE00 496 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 OR6J1Q8NGC5 347 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC107Q8WV48 283 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FBXL20Q96IG2 436 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 WWTR1Q9GZV5 400 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LHPPQ9H008 270 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC26A1Q9H2B4 701 aa5.46□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 APEX2Q9UBZ4 518 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SLC6A5Q9Y345 797 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CMAHPQ9Y471 501 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PLSCR5A0PG75 271 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 H0YIV9 168 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 AQP7O14520 342 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CDRT1O95170 752 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ADORA3P0DMS8 318 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 G6PDP11413 515 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GKP32189 559 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CD86P42081 329 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SRP9P49458 86 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 LIPEQ05469 1076 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 APOFQ13790 326 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF311Q5JNZ3 666 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 RANBP10Q6VN20 620 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 RNF31Q96EP0 1072 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PCYOX1Q9UHG3 505 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 KIF25Q9UIL4 384 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.45□□□□□ -1.54
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PTPRC-209ENST00000442510 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 EFCAB5A4FU69 1503 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CLDN4O14493 209 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 PEX10O60683 326 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 GADD45GO95257 159 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 CST1P01037 141 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRC-209ENST00000442510 ALPLP05186 524 aa5.45□□□□□ -1.54
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