RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439890.3

NANOGP9-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP9, Length 892 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP9-201ENST00000439890 RAD51Q06609 339 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 FCHO2Q0JRZ9 810 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 IHHQ14623 411 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 POU6F1Q14863 301 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 E2F5Q15329 346 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 UGP2Q16851 508 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 INSCQ1MX18 579 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM65Q6PI78 240 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LINGO4Q6UY18 593 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PACS1Q6VY07 963 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 GALNT7Q86SF2 657 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 KCNMB4Q86W47 210 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 MFSD6LQ8IWD5 586 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CNTN4Q8IWV2 1026 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 NDUFAF2Q8N183 169 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 KDM1BQ8NB78 822 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 OR2AP1Q8NGE2 309 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ACMSDQ8TDX5 336 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 STYXQ8WUJ0 223 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SPSB4Q96A44 273 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ELSPBP1Q96BH3 223 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 RMDN1Q96DB5 314 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 NECTIN4Q96NY8 510 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SELENOSQ9BQE4 189 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM167BQ9BTA0 163 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CAPS2Q9BXY5 557 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CDH19Q9H159 772 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 S1PR5Q9H228 398 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CHRAC1Q9NRG0 131 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SNX15Q9NRS6 342 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CLEC4EQ9ULY5 219 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 RAI2Q9Y5P3 530 aa5.66□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CEP290O15078 2479 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TMEM120BA0PK00 339 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 FAM47DPA6NHR8 397 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 C2orf81A6NN90 581 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 WASH3PC4AMC7 463 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TRIM49D1C9J1S8 452 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TM9SF1O15321 606 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LINC01565O15544 149 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LDB2O43679 373 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TULP3O75386 442 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ECI2O75521 394 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ZWINTO95229 277 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PGLSO95336 258 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 POP4O95707 220 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CISD3P0C7P0 127 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ERVK-10P10266 1014 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LAMP2P13473 410 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CHN1P15882 459 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PSMC3P17980 439 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 FCARP24071 287 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 NFKBIAP25963 317 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SERPINA4P29622 427 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 LIMK2P53671 638 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 PSG6Q00889 435 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 BCL2L1Q07817 233 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TRAF2Q12933 501 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 DLG2Q15700 870 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CNGA3Q16281 694 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 MYLK3Q32MK0 819 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 FUT11Q495W5 492 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CARD16Q5EG05 197 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 C22orf39Q6P5X5 142 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CES3Q6UWW8 571 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 MTSS1LQ765P7 747 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 KDELC2Q7Z4H8 507 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 YAF2Q8IY57 180 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 RSPRY1Q96DX4 576 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 CABS1Q96KC9 395 aa5.65□□□□□ -1.5
NANOGP9-201ENST00000439890 MSLNLQ96KJ4 702 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms