RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTP4A2Q12974 167 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CUL1Q13616 776 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CRYMQ14894 314 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KA2Q15349 733 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYP2A13Q16696 494 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT79Q5XKE5 535 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRAGAQ7L523 313 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TADA2BQ86TJ2 420 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPBP1Q86WP2 473 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XYLT1Q86Y38 959 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BANPQ8N9N5 519 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KYQ8NBH2 561 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMX1AQ8TE12 382 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DUSP19Q8WTR2 217 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CORO2AQ92828 525 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SGK3Q96BR1 496 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRC39Q96DD0 335 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYEOVQ96EZ4 313 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMLNQ96KR4 655 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP28Q96RU2 1077 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRADBQ9C0K7 418 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHODLQ9H9P2 273 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNK13Q9HB14 408 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAB20Q9NX57 234 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HMGXB4Q9UGU5 601 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP6V1HQ9UI12 483 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SARDHQ9UL12 918 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NFS1Q9Y697 457 aa5.52□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RTTNQ86VV8 2226 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACANP16112 2415 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBC2A0A5B9 178 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF879B4DU55 563 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACOT7O00154 380 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASGRF2O14827 1237 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PFKFB2O60825 505 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NIPSNAP2O75323 286 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKR7A3O95154 331 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HPXP02790 462 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSF2P04141 144 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCL4P13236 92 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSNK2BP67870 215 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PMP22Q01453 160 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MGAT5Q09328 741 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MALLQ13021 153 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C1orf61Q13536 156 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IRF3Q14653 427 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf72Q14CZ0 275 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPS6KA1Q15418 735 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATAD3BQ5T9A4 648 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP17Q68EM7 881 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLFN12LQ6IEE8 588 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NEK5Q6P3R8 708 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERICH5Q6P6B1 374 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RFWD3Q6PCD5 774 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q6ZSR6 202 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB18Q6ZVZ8 466 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACOT1Q86TX2 421 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NECAB1Q8N987 351 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POC5Q8NA72 575 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf20Q8ND61 904 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RSC1A1Q92681 617 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LURAP1Q96LR2 239 aa5.51□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms