RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 KCNN1Q92952 543 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GLYATL1Q969I3 302 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 COPS4Q9BT78 406 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC2A11Q9BYW1 496 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NR4A1P22736 598 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MYL9P24844 172 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CST5P28325 142 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TIE1P35590 1138 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PREPP48147 710 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 DSTNP60981 165 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GRB7Q14451 532 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FAM129CQ86XR2 697 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SHKBP1Q8TBC3 707 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PIGXQ8TBF5 258 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 AIG1Q9NVV5 245 aa15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 KMOO15229 486 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PRMT3O60678 531 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF423Q2M1K9 1284 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OR10G2Q8NGC3 310 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 UBASH3BQ8TF42 649 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC16A5O15375 505 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ITPKBP27987 946 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FCGR1BQ92637 280 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC45A3Q96JT2 553 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FBXL12Q9NXK8 326 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PHF24Q9UPV7 400 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HAT1O14929 419 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HLA-EP13747 358 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TCEAL8Q8IYN2 117 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 COL21A1Q96P44 957 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TPK1Q9H3S4 243 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 K7ERQ8 282 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 B3GALT2O43825 422 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 MPC1LP0DKB6 136 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IL7RP16871 459 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CDK6Q00534 326 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TMC8Q8IU68 726 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa15.61■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 M0QX08 132 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TM4SF4P48230 202 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ZBED5Q49AG3 693 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 LIPJQ5W064 366 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FIBINQ8TAL6 211 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PYURFQ96I23 114 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OR51B5Q9H339 312 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IL1RAPQ9NPH3 570 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 LRRC14BA6NHZ5 514 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 GRID2O43424 1007 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 AIREO43918 545 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 FPR1P21462 350 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.092e-16■■■■□ 21.5
C9orf172-201ENST00000436881 GK3PQ14409 553 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PTGR1Q14914 329 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PIGGQ5H8A4 983 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PGM2L1Q6PCE3 622 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RFKQ969G6 155 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 COMMD2Q86X83 199 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM145Q8NBT3 493 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 OR8J3Q8NGG0 315 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.6■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 DRGXA6NNA5 263 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CASKO14936 926 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CHST10O43529 356 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 SCN2BO60939 215 aa15.59■□□□□ 0.09
C9orf172-201ENST00000436881 CLIC3O95833 236 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms