RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 CD86P42081 329 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HALP42357 657 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCG1P45844 678 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GNPDA1P46926 289 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARCKSL1P49006 195 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRP54P61011 504 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT2Q10471 571 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP1B1Q10567 949 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FOXI1Q12951 378 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZBTB17Q13105 803 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLMHQ13867 455 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTK2BQ14289 1009 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPARCL1Q14515 664 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC18A3Q16572 532 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM52BQ4KMG9 183 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ODF2Q5BJF6 829 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MARC1Q5VT66 337 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALS2CLQ60I27 953 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRC66Q68CR7 880 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC30A9Q6PML9 568 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRIP3Q6Q6R5 217 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6YL49 198 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZNX1 250 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 H2AFVQ71UI9 128 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DPPA4Q7L190 304 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF627Q7L945 461 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZSCAN30Q86W11 494 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS12Q86WS5 348 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFX6Q8HWS3 928 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC50Q8IVM0 306 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBS5Q8N3I7 341 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARL10Q8N8L6 244 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG16L2Q8NAA4 619 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCTD6Q8NC69 237 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCNYQ8ND76 341 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR56A4Q8NGH8 313 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEKT4Q8WW24 435 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PATE1Q8WXA2 126 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RFFLQ8WZ73 363 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAPGEF5Q92565 580 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ECHDC3Q96DC8 303 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTD2Q96FN9 168 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSKH2Q96QS6 385 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LGMNQ99538 433 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHP1Q99653 195 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MGME1Q9BQP7 344 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF670Q9BS34 389 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 APOOQ9BUR5 198 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EDEM3Q9BZQ6 932 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCG4Q9H172 646 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ABCG8Q9H221 673 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DONSONQ9NYP3 566 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR34Q9UPC5 381 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHKBQ9Y259 395 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MYRFQ9Y2G1 1151 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.37□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GRID2IPA4D2P6 1211 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2W5A6NFC9 320 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMO7DNF2Z398 122 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF6BO95407 300 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRB1P04280 392 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT7P08729 469 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HKR1P10072 659 aa4.36□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.2 ms