RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DPH7Q9BTV6 452 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SARGQ9BW04 601 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PELI2Q9HAT8 420 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM60AQ9NP50 221 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDE7BQ9NP56 450 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BATF3Q9NR55 127 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OXSMQ9NWU1 459 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COPG2Q9UBF2 871 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCTPQ9UKL6 214 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH2B3Q9UQQ2 575 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa7.84□□□□□ -1.15
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFCAB7A8K855 629 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 E7EQ34 232 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H3BMH7 237 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H7BY64 318 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HAT1O14929 419 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NRP2O60462 931 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UGDHO60701 494 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAMEF10O60809 474 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAMEF4O60810 478 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTSVO60911 334 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KATNA1O75449 491 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WFS1O76024 890 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF5P12034 268 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCL4P13236 92 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOLR1P15328 257 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IMPDH1P20839 514 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SH3BP2P78314 561 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSNK1G2P78368 415 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MC2RQ01718 297 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TUBB3Q13509 450 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPP2Q14168 576 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RTP5Q14D33 572 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCLAFQ15004 111 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTMPQ5BVD1 217 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LIPMQ5VYY2 423 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATG9BQ674R7 924 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SNX31Q8N9S9 440 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC63Q8NA47 563 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARL8AQ96BM9 186 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZBTB9Q96C00 473 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THAP11Q96EK4 314 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FCRL4Q96PJ5 515 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM111AQ96PZ2 611 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM237Q96Q45 408 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EFCAB11Q9BUY7 163 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DDA1Q9BW61 102 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCNM1Q9BWG6 230 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FGF21Q9NSA1 209 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OCIAD1Q9NX40 245 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KLK13Q9UKR3 277 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSRB2Q9Y3D2 182 aa7.83□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRBC2A0A5B9 178 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM120BA0PK00 339 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FITM1A5D6W6 292 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR7A17O14581 309 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BIRC5O15392 142 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HCRTR1O43613 425 aa7.82□□□□□ -1.16
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms