RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DOK6Q6PKX4 331 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMPRSS11BQ86T26 416 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PANX1Q96RD7 426 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFXN1Q9H9B4 322 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DMTF1Q9Y222 760 aa18.08■□□□□ 0.49
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FPGTO14772 594 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYO1DO94832 1006 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINA1P01009 418 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CST1P01037 141 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALPLP05186 524 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAE1P78406 368 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2H3Q13889 308 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAG1Q14118 895 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BORAQ6PGQ7 559 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 USP51Q70EK9 711 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDC26Q8NHZ8 85 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGIXQ9H6Y5 334 aa18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRANK1O15050 2925 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH3BGRLO75368 114 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CALRP27797 417 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCR3P51677 355 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LBX1P52954 281 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDH15P55291 814 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCM1Q15154 2024 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DUSP6Q16828 381 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERPINA11Q86U17 422 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK32CQ86UX6 486 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TBC1D3BA6NDS4 549 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANTXRLA6NF34 631 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EVPLLA8MZ36 301 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0YAE9 185 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QCP02747 245 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPPBP16860 134 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL1RNP18510 177 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FCARP24071 287 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IL12RB1P42701 662 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALDH3B2P48448 385 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PDGFRLQ15198 375 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MED27Q6P2C8 311 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STARD8Q92502 1023 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUSD6Q92537 303 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERLEC1Q96DZ1 483 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGPP1Q9BX95 441 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CERS4Q9HA82 394 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR34Q9UPC5 381 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.07■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC160A6NGH7 325 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM64A6NGJ6 449 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 G3V2T6 193 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLIC1O00299 241 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALBP02768 609 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMP1P11279 417 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 P2RY2P41231 377 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IST1P53990 364 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PNLIPRP1P54315 467 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERVK-21P61565 698 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAPTM5Q13571 262 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NFE2L1Q14494 772 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STARD3Q14849 445 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPIN4Q56A73 249 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLECL1Q8IZS7 167 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC4FQ8N1N0 589 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR9A1PQ8NGU1 263 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2L2Q8NH16 312 aa18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR34Q96EX3 536 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms