RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413409.6

PTPRC-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,338 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-206ENST00000413409 EPB42P16452 691 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 SLC6A12P48065 614 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 RXRGP48443 463 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 LSSP48449 732 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 PRLHRP49683 370 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HTR6P50406 440 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 GSTM4Q03013 218 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 RCAN2Q14206 197 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 FLOT2Q14254 428 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 MUM1Q2TAK8 710 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 LINC00303Q3SY05 128 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 MILR1Q7Z6M3 343 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SLC26A7Q8TE54 656 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DNAJC9Q8WXX5 260 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ARRDC3Q96B67 414 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 AP2M1Q96CW1 435 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.57■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 ANGPT2O15123 496 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 SUV39H1O43463 412 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SLCO2B1O94956 709 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 CAPN3P20807 821 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ATP6V1C1P21283 382 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 CD38P28907 300 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 RPIAP49247 311 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 NXPH1P58417 271 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 E2F1Q01094 437 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DET1Q7L5Y6 550 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.56■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 ASB9Q96DX5 294 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 CDK15Q96Q40 435 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 ASIC5Q9NY37 505 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM181Q9P2C4 612 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SERGEFQ9UGK8 458 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 CREBBPQ92793 2442 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 FAM234BA2RU67 622 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 E7ENX8 843 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ACOT8O14734 319 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 SIGLEC6O43699 453 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DNTTP04053 509 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HIST1H2ADP20671 130 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 DIO3P55073 304 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 KCNK10P57789 538 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.55■□□□□ 0.24
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PTPRC-206ENST00000413409 Q6ZSR9 355 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 RETREG3Q86VR2 466 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 NLRP8Q86W28 1048 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SFRP1Q8N474 314 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 PYDC1Q8WXC3 89 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 FBXL8Q96CD0 374 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SPDL1Q96EA4 605 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 SLC52A3Q9NQ40 469 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 ABCD2Q9UBJ2 740 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 CD300AQ9UGN4 299 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 A0A1W2PP18 115 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 H3BNX3 289 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 TLR4O00206 839 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
PTPRC-206ENST00000413409 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
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