RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 AIREO43918 545 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP20O60882 483 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CYP7B1O75881 506 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 APBB3O95704 486 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ALPIP09923 528 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NAT2P11245 290 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ACP5P13686 325 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PCSK2P16519 638 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MATN1P21941 496 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LHCGRP22888 699 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD40LGP29965 261 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NTSP30990 170 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRKAR1BP31321 381 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VIPR1P32241 457 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NSG1P42857 185 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC1A6P48664 564 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MARCKSL1P49006 195 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARFIP1P53367 373 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC10A7Q0GE19 358 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ELOCQ15369 112 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GALNT7Q86SF2 657 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DSELQ8IZU8 1212 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CLYBLQ8N0X4 340 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 METTL4Q8N3J2 472 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 POU5F2Q8N7G0 328 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF283Q8N7M2 679 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLM1Q8NBJ4 401 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 COL26A1Q96A83 441 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR5B12Q96R08 314 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NODALQ96S42 347 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NPY6RQ99463 290 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KCNS3Q9BQ31 491 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM83CQ9BQN1 747 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RGCCQ9H4X1 137 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC19Q9H756 370 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT15Q9NV35 164 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARMC1Q9NVT9 282 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HSFX1Q9UBD0 423 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SCML1Q9UN30 329 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR1DQ9Y2S0 133 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TRAF6Q9Y4K3 522 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ARL5AQ9Y689 179 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 VILLO15195 856 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS14O43566 566 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUAK1O60285 661 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 MPZL2O60487 215 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SH3BGRLO75368 114 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEC22BO75396 215 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT33AO76009 404 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 NUDT14O95848 222 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ASGR2P07307 311 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 BMP7P18075 431 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ECHS1P30084 290 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CAV3P56539 151 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RPS21P63220 83 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM189BP81408 668 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FGL2Q14314 439 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CERCAMQ5T4B2 595 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 AADACL2Q6P093 401 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRTM4Q86VH4 590 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 RELL1Q8IUW5 271 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR2L2Q8NH16 312 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 OR8K3Q8NH51 312 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO30Q8TB52 745 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHO2Q8TD55 490 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 TLCD1Q96CP7 247 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 PHOX2BQ99453 314 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 ZBP1Q9H171 429 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 CD320Q9NPF0 282 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 FANCFQ9NPI8 374 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.3□□□□□ -1.72
ANKRD28-202ENST00000412318 SEC14L4Q9UDX3 406 aa4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.1 ms