RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 TUSC3Q13454 348 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 RNF121Q9H920 327 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 SLC35A5Q9BS91 424 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 TSSK6Q9BXA6 273 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 FBXL3Q9UKT7 428 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 OR10H2O60403 315 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SLC19A2O60779 497 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 NPPAP01160 153 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SPATA31D3P0C874 917 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 AGXTP21549 392 aa9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 GALEQ14376 348 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 33.9
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HERC3-202ENST00000402738 TBC1D15Q8TC07 691 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-202ENST00000402738 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 C22orf31O95567 290 aa9.53□□□□□ -0.88
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HERC3-202ENST00000402738 CBX5P45973 191 aa9.53□□□□□ -0.88
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