RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 EMX2Q04743 252 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR10G6Q8NH81 332 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OSER1Q9NX31 292 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MS4A12Q9NXJ0 267 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RICTORQ6R327 1708 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SNAPC5O75971 98 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AP1S1P61966 158 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK6Q00534 326 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LRRC66Q68CR7 880 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM46DQ8NEK8 389 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 STOML3Q8TAV4 291 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SMURF1Q9HCE7 757 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC3A1Q07837 685 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NRG4Q8WWG1 115 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C5orf34Q96MH7 638 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ALPK1Q96QP1 1244 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXW2Q9UKT8 454 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SOX14O95416 240 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GLUD1P00367 558 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 T-ENOLP0DO92 83 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AVPR1BP47901 424 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GRK1Q15835 563 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF627Q7L945 461 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM17Q86X19 198 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM199Q8N511 208 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXL18Q96ME1 805 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC39A1Q9NY26 324 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CD84Q9UIB8 345 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 COL1A2P08123 1366 aa18.11■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CDK4P11802 303 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RABGGTBP53611 331 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 UGT2A3Q6UWM9 527 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF367Q7RTV3 350 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5AK3PQ8NH89 298 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PTPN18Q99952 460 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MKS1Q9NXB0 559 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 KIF1AQ12756 1690 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A1B0GVM2 712 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 E7ESA3 106 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR1F1O43749 312 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RP2O75695 350 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 MYF6P23409 242 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 DNASE1P24855 282 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GSTM2P28161 218 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 RFC2P35250 354 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CDH11P55287 796 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF678Q5SXM1 525 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ALPPP05187 535 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GRK5P34947 590 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 GRIA2P42262 883 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CD97P48960 835 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CLCA4Q14CN2 919 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FRG2Q64ET8 278 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF676Q8N7Q3 588 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 FRG2BQ96QU4 278 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF350Q9GZX5 532 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PIGVQ9NUD9 493 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ERVK13-1Q9NX77 482 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ACVR2AP27037 513 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 PIK3CBP42338 1070 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR3A3P47888 321 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 OR3A2P47893 321 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 BMXP51813 675 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TWNKQ96RR1 684 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CORO1BQ9BR76 489 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R3Q9NYW6 316 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.1■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 STBD1O95210 358 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 APOC3P02656 99 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 CBFBQ13951 182 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 TCEANCQ8N8B7 351 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 SCRN2Q96FV2 425 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 LRCH3Q96II8 777 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 NDC1Q9BTX1 674 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 ASAH2Q9NR71 780 aa18.09■□□□□ 0.49
AMIGO1-202ENST00000369864 EXTL2Q9UBQ6 330 aa18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms