RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBC1D7Q9P0N9 293 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TXNDC16Q9P2K2 825 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MUTYHQ9UIF7 546 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGSF1Q8N6C5 1336 aa2.59□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 EPM2AB3EWF7 344 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2CD4DB7Z1M9 353 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSRP00390 522 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADRB2P07550 413 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RGS19P49795 217 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMK1P53667 647 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN15P56746 228 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRX4P78413 519 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBPJQ06330 500 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSM1Q08AH1 577 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN14Q15678 1187 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD4BQ5TF39 518 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINK14Q6IE38 97 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTR9Q6PD62 1173 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP1BQ7LBR1 199 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMNTD2Q8IXW0 634 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD6Q8NC69 237 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR5T2Q8NGG2 359 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIPOL1Q8TD10 442 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIK3R3Q92569 461 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGAP4Q96P64 663 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXD1Q9GZZ0 328 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PANK3Q9H999 370 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 WIPI2Q9Y4P8 454 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSAG2Q9Y5P2 127 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZHX2Q9Y6X8 837 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LOC105371242A0A075B767 164 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRAV24A0A0B4J272 114 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASB14A6NK59 587 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL24O00175 119 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6AP2O75787 350 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM4O75871 244 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAG3O95817 575 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52Z1P0C646 297 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACHEP22303 614 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX3P41225 446 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR3A2P47893 321 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPCMLQ14982 345 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CST9LP1Q5W188 147 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT80Q6KB66 452 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF343Q6P1L6 599 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC24A5Q71RS6 500 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZER1Q7Z7L7 766 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCGF5Q86SE9 256 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFN1Q8IWA4 741 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPAG16Q8N0X2 631 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL4Q8N3J2 472 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMER3Q8N944 861 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2L2Q8NH16 312 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPSB1Q96BD6 273 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2orf48Q96LS8 159 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP57Q96MR6 1250 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC3BQ96PB8 259 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGMNQ99538 433 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS10P5Q9NQ39 176 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR35Q9P2L0 1181 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFECO14948 347 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIAPH2O60879 1101 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 THEGLP0DJG4 465 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYL6BP14649 208 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAPN2P17655 700 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDHA2P29803 388 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 CETN2P41208 172 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD52P43351 418 aa2.56□□□□□ -2
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBASH3AP57075 661 aa2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms