RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 USP43Q70EL4 1123 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 USP29Q9HBJ7 922 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 TXNRD2Q9NNW7 524 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 NPIPA1Q9UND3 350 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 CDH1P12830 882 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 ID2Q02363 134 aa21.79■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 DSC3Q14574 896 aa21.79■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 METTL7AQ9H8H3 244 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 PSKH1P11801 424 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 CAPN14A8MX76 684 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 DPPA5A6NC42 116 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.78■■□□□ 1.08
PTPRM-201ENST00000332175 FRMD7Q6ZUT3 714 aa21.78■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 GSTT2BP0CG30 244 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 OR51B5Q9H339 312 aa21.77■■□□□ 1.08
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PTPRM-201ENST00000332175 H0YGN5 161 aa21.77■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 CNTN5O94779 1100 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 MTTPP55157 894 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa21.77■■□□□ 1.07
PTPRM-201ENST00000332175 THEM6Q8WUY1 208 aa21.77■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 DNAJB8Q8NHS0 232 aa21.76■■□□□ 1.07
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PTPRM-201ENST00000332175 WASHC1A8K0Z3 465 aa21.76■■□□□ 1.07
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