RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331803.8

UPP1-201, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UPP1, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-201ENST00000331803 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.49■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PCM1Q15154 2024 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 A0A1W2PPV9 198 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 NME4O00746 187 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TOR1BO14657 336 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 CD6P30203 668 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RAB28P51157 221 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 STARD6P59095 220 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SRP54P61011 504 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ACSM2AQ08AH3 577 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SPANXN4Q5MJ08 99 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ACSM2BQ68CK6 577 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 FAM129CQ86XR2 697 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PYDC1Q8WXC3 89 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 UBE2E3Q969T4 207 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SHDQ96IW2 340 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 FOXQ1Q9C009 403 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 STOML1Q9UBI4 398 aa18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SH3BGRLO75368 114 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PGRP06401 933 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 AK4P27144 223 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RABIFP47224 123 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TCEA2Q15560 299 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 LPCAT2Q7L5N7 544 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 DHDDSQ86SQ9 333 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 DEFB123Q8N688 67 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 FRMD1Q8N878 549 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ZNF740Q8NDX6 193 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 EGLN2Q96KS0 407 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 EBPLQ9BY08 206 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TMEM168Q9H0V1 697 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 XKR8Q9H6D3 395 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 CMTM6Q9NX76 183 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 DMTF1Q9Y222 760 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ZNF217O75362 1048 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RASGRP1O95267 797 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ANP32DO95626 131 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ANPEPP15144 967 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SESN3P58005 492 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 MAPKAPK3Q16644 382 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ALG11Q2TAA5 492 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 DLEU7Q6UYE1 221 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 WASH2PQ6VEQ5 465 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 KIAA2013Q8IYS2 634 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 KRT78Q8N1N4 520 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 OR13H1Q8NG92 308 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 OR52E1Q8NGJ3 308 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 CCL4L1Q8NHW4 92 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 CHTF18Q8WVB6 975 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RLN3Q8WXF3 142 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TPSD1Q9BZJ3 242 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PELI2Q9HAT8 420 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 NMRK1Q9NWW6 199 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa18.47■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 MYO1DO94832 1006 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 EML2O95834 649 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 PSMB5P28074 263 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SF1Q15637 639 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SPIN4Q56A73 249 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 NANOGP8Q6NSW7 305 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 SYT12Q8IV01 421 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ADHFE1Q8IWW8 467 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 RIMKLAQ8IXN7 391 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 OR2L8Q8NGY9 312 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 NANOGQ9H9S0 305 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa18.46■□□□□ 0.55
UPP1-201ENST00000331803 LRATO95237 230 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 PKLRP30613 574 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 ACTR1BP42025 376 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 PIK3CBP42338 1070 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 ACTR1AP61163 376 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 PWP1Q13610 501 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 RABL3Q5HYI8 236 aa18.45■□□□□ 0.54
UPP1-201ENST00000331803 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms