RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323081.12

SPNS1-202, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPNS1, Length 2,102 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-202ENST00000323081 TRPC1P48995 793 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PPP2R2BQ00005 443 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ACSM2AQ08AH3 577 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PMS2P3Q13401 168 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DPY19L1Q2PZI1 675 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ACSM2BQ68CK6 577 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 KCTD8Q6ZWB6 473 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 FAM210AQ96ND0 272 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RDH12Q96NR8 316 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CXorf21Q9HAI6 301 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SGK2Q9HBY8 427 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 FAM118AQ9NWS6 357 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 C5orf67F2Z3F1 127 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF197O14709 1029 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SH3BGRLO75368 114 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 IMPA1P29218 277 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HNF4AP41235 474 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 VIPR2P41587 438 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HLCSP50747 726 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ST8SIA6P61647 398 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SPIDRQ14159 915 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD34AQ69YU3 496 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 GRHL2Q6ISB3 625 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF621Q6ZSS3 439 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 EID3Q8N140 333 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HERVK_113Q902F9 699 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 FOPNLQ96NB1 174 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 LTB4R2Q9NPC1 389 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 USE1Q9NZ43 259 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 LMCD1Q9NZU5 365 aa17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PRRT4C9JH25 899 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 H0YIV9 168 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CLIC1O00299 241 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SPINT1O43278 529 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 B4GAT1O43505 415 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PRMT3O60678 531 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CCNDBP1O95273 360 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ENGP17813 658 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 IL1RNP18510 177 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PRKACGP22612 351 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DCKP27707 260 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DCTP40126 519 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 STT3AP46977 705 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 WNT3P56703 355 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 TTC23Q5W5X9 447 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 THAP5Q7Z6K1 395 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SERPINA11Q86U17 422 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF555Q8NEP9 628 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 OR5K1Q8NHB7 308 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 NXPE3Q969Y0 559 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 MBOAT4Q96T53 435 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DOK1Q99704 481 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 COQ6Q9Y2Z9 468 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 U3KQV3 271 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SH3PXD2BA1X283 911 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 MAGEB17A8MXT2 336 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SCN2BO60939 215 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 MYO1DO94832 1006 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 EPN2O95208 641 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ETHE1O95571 254 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZNF682O95780 498 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 EPS8Q12929 822 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 RAB39AQ14964 217 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 NRSN1Q8IZ57 195 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PJA1Q8NG27 643 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 ZFYVE19Q96K21 471 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 TBCCD1Q9NVR7 557 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 CDC14AQ9UNH5 594 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa17.03■□□□□ 0.32
SPNS1-202ENST00000323081 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms