RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC63Q8NA47 563 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 OR1L3Q8NH93 324 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PGM2Q96G03 612 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 THSD1Q9NS62 852 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 FOXJ2Q9P0K8 574 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SERTAD3Q9UJW9 196 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.42■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
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HOXD4-201ENST00000306324 CDRT15L2A8MXV6 281 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 E7EQ34 232 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 K7EPI3 171 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 NVLO15381 856 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PROCP04070 461 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CREB1P16220 341 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CSNK1G2P78368 415 aa21.41■■□□□ 1.02
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HOXD4-201ENST00000306324 FBXO42Q6P3S6 717 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 RNF44Q7L0R7 432 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ABHD11Q8NFV4 315 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZPBPQ9BS86 351 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CAPS2Q9BXY5 557 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MKS1Q9NXB0 559 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.41■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 STX16O14662 325 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CLGNO14967 610 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PLIN3O60664 434 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GRK3P35626 688 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ITGA1P56199 1179 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 NXPE4Q6UWF7 544 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM126BQ8IUX1 230 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GPR135Q8IZ08 494 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TEX9Q8N6V9 391 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 OR8K5Q8NH50 307 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 GPRC5BQ9NZH0 403 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SEC16AO15027 2179 aa21.4■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 FEZF1A0PJY2 475 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 DLX3O60479 287 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 OR2B3O76000 313 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TIAF1O95411 115 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 CTSBP07858 339 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 MYL2P10916 166 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 EPB42P16452 691 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
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HOXD4-201ENST00000306324 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 EXOC3L1Q86VI1 746 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ULBP3Q9BZM4 244 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PELI2Q9HAT8 420 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 PLLPQ9Y342 182 aa21.39■■□□□ 1.02
HOXD4-201ENST00000306324 ACACAQ13085 2346 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SCRG1O75711 98 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 C1QTNF9P0C862 333 aa21.39■■□□□ 1.01
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HOXD4-201ENST00000306324 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 OR4N4Q8N0Y3 316 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 OR4K1Q8NGD4 311 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 TCP10LQ8TDR4 215 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SPNS1Q9H2V7 528 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 STARD5Q9NSY2 213 aa21.39■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 IGF2RP11717 2491 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 H0YGG7 62 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 E2F3O00716 465 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF28P17035 718 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 EPORP19235 508 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXD4-201ENST00000306324 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
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