RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294304.11

LRP5-201, Transcript of LDL receptor related protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP5, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5-201ENST00000294304 TAB1Q15750 504 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 UNC50Q53HI1 259 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TMEM74Q96NL1 305 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TOX2Q96NM4 488 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 MGME1Q9BQP7 344 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LRP5O75197 1615 aa20.63■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ASNA1O43681 348 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TMCC2O75069 709 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ANXA8P13928 327 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 EPCAMP16422 314 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ATP4BP51164 291 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SLC9B2Q86UD5 537 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LMX1AQ8TE12 382 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 MCM8Q9UJA3 840 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 OPN1SWP03999 348 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PFKLP17858 780 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.895e-7■■■□□ 16.7
LRP5-201ENST00000294304 RAB41Q5JT25 222 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PMEPA1Q969W9 287 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 USP54Q70EL1 1684 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SDHDO14521 159 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LDB2O43679 373 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 OR5F1O95221 314 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SRCP12931 536 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 BPIP17213 487 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 IL4RP24394 825 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 RABL3Q5HYI8 236 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 GPR153Q6NV75 609 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 GKN2Q86XP6 184 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PSMA8Q8TAA3 256 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 OR2M4Q96R27 311 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 IKZF2Q9UKS7 526 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ABHD18Q0P651 414 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 DAG1Q14118 895 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 USP3Q9Y6I4 520 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SCN7AQ01118 1682 aa20.62■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 VEGFDO43915 354 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PCDH1Q08174 1060 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LIPJQ5W064 366 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 S100ZQ8WXG8 99 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PHF11Q9UIL8 331 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 H7BY64 318 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 RGS21Q2M5E4 152 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LIN52Q52LA3 116 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 MZT2BQ6NZ67 158 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SCRN2Q96FV2 425 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PRAP1Q96NZ9 151 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ZIC5Q96T25 663 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CDADC1Q9BWV3 514 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 OAZ3Q9UMX2 235 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 A0A1W2PQU0 124 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CHST10O43529 356 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 AGR2O95994 175 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SPINT3P49223 89 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 RAB14P61106 215 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CDK6Q00534 326 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SYVN1Q86TM6 617 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 DEFB119Q8N690 84 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CASKO14936 926 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 BNC1Q01954 994 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 DENND1AQ8TEH3 1009 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 RFKQ969G6 155 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CMTM6Q9NX76 183 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.61■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 OR10G2Q8NGC3 310 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 CLSTN3Q9BQT9 956 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 SHMT2P34897 504 aa20.6■□□□□ 0.89
LRP5-201ENST00000294304 RCVRNP35243 200 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms