RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 C10orf53Q8N6V4 93 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NETO1Q8TDF5 533 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF607Q96SK3 696 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RNF39Q9H2S5 420 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 COMMD9Q9P000 198 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa14.68□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CAPN15O75808 1086 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF806P0C7X5 589 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PRPS1L1P21108 318 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SSTR4P31391 388 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TMEM151AQ8N4L1 468 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 STX16O14662 325 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GABRB3P28472 473 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 XKP51811 444 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GPAT3Q53EU6 434 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 C22orf42Q6IC83 251 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FAM92BQ6ZTR7 304 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TMED9Q9BVK6 235 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PDLIM7Q9NR12 457 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PHF11Q9UIL8 331 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MEN1O00255 615 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ASMTP46597 345 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ARHGEF6Q15052 776 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OSTM1Q86WC4 334 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 GTF2H4Q92759 462 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TXNDC15Q96J42 360 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RAD18Q9NS91 495 aa14.67□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 A0A0G2JPF8 293 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SLC35F4A4IF30 521 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BMP7P18075 431 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BEX3Q00994 111 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CACNG1Q06432 222 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SELENBP1Q13228 472 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SPHARQ15513 63 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PROX2Q3B8N5 592 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OR10T2Q8NGX3 314 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SNX18Q96RF0 628 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 LTB4R2Q9NPC1 389 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 A0A1W2PQ09 198 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SOBPA7XYQ1 873 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CHST10O43529 356 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 IL10RBQ08334 325 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 CBLBQ13191 982 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZBTB6Q15916 424 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KANK2Q63ZY3 851 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ATG9BQ674R7 924 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RGL4Q8IZJ4 473 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 FAM109AQ8N4B1 249 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 OR5AK3PQ8NH89 298 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TRPM4Q8TD43 1214 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ING5Q8WYH8 240 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ZNF382Q96SR6 550 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 BRD9Q9H8M2 597 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 RNF121Q9H920 327 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 M0R233 179 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 INSIG1O15503 277 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TCF3P15923 654 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 PIGAP37287 484 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 VMACQ2NL98 169 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 UAP1L1Q3KQV9 507 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 LIN54Q6MZP7 749 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.66□□□□□ -0.06
CASC3-201ENST00000264645 MAB21L2Q9Y586 359 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms