RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263956.7

GTF3C3-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C3, Length 4,282 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3-201ENST00000263956 SLC13A2Q13183 592 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CDKN3Q16667 212 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 GATAD2AQ86YP4 633 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 PLD3Q8IV08 490 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 DTX3LQ8TDB6 740 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 GAB3Q8WWW8 586 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 BIRC8Q96P09 236 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 H0Y3Z8 333 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CRATP43155 626 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MESP2Q0VG99 397 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SNCBQ16143 134 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 DPY19L1Q2PZI1 675 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 KRT73Q86Y46 540 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MCMBPQ9BTE3 642 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TEX12Q9BXU0 123 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TEX101Q9BY14 249 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 BRINP2Q9C0B6 783 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 P2RY12Q9H244 342 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 RASSF4Q9H2L5 321 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 PIF1Q9H611 641 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 RARRES3Q9UL19 164 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TMED5Q9Y3A6 229 aa8□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CBX6O95503 412 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 STATHP02808 62 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 HSD3B1P14060 373 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 HSD3B2P26439 372 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ALG11Q2TAA5 492 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MLIPQ5VWP3 458 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 LCTLQ6UWM7 567 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 IQCHQ86VS3 1027 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 OR5K2Q8NHB8 316 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ACTRT2Q8TDY3 377 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 PELI2Q9HAT8 420 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 A0A1W2PQF6 199 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 LRRC14BA6NHZ5 514 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 NRP2O60462 931 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 OR2B3O76000 313 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SLCO2B1O94956 709 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 KLK1P06870 262 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 PRPS1L1P21108 318 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MAPK10P53779 464 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ACY1Q03154 408 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CHRNB3Q05901 458 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 MPP2Q14168 576 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TCTE1Q5JU00 501 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 METRNLQ641Q3 311 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TMEM26Q6ZUK4 368 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 DLG3Q92796 817 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 L3HYPDHQ96EM0 354 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CCDC134Q9H6E4 229 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 BRWD1Q9NSI6 2320 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 A0A0J9YY10 115 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TMEM233B4DJY2 109 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 UBXN7O94888 489 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 C16orf62Q7Z3J2 963 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 SYVN1Q86TM6 617 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 NATD1Q8N6N6 113 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZNF480Q8WV37 535 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 VPS33AQ96AX1 596 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TADA1Q96BN2 335 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CDRT15Q96T59 188 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 LGR4Q9BXB1 951 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 TM7SF3Q9NS93 570 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ATP6V1HQ9UI12 483 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 PCTPQ9UKL6 214 aa7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 KRBA1A5PL33 1030 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 CYP7B1O75881 506 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 ZNF682O95780 498 aa7.98□□□□□ -1.13
GTF3C3-201ENST00000263956 JAK1P23458 1154 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms