RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 TTLL9Q3SXZ7 439 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 TXNDC8Q6A555 127 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 LACC1Q8IV20 430 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB2Q8N680 514 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SLC29A3Q9BZD2 475 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 DCSTAMPQ9H295 470 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RETREG1Q9H6L5 497 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ABCB10Q9NRK6 738 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 WBP1LQ9NX94 342 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 POU2F3Q9UKI9 436 aa23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 LRATO95237 230 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 FABP3P05413 133 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 LIPAP38571 399 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ZXDBP98169 803 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 GPRC6AQ5T6X5 926 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 UBE2UQ5VVX9 321 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RBFAQ8N0V3 343 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 EGLN2Q96KS0 407 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SLX1AQ9BQ83 275 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 YIPF2Q9BWQ6 316 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KRT84Q9NSB2 600 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 VPS51Q9UID3 782 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RFXANKO14593 260 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 CLDN9O95484 217 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SDC1P18827 310 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 NEK2P51955 445 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SYT16Q17RD7 645 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PROX2Q3B8N5 592 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PRSS36Q5K4E3 855 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SERPINA11Q86U17 422 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SP140LQ9H930 580 aa23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KIAA1671Q9BY89 1806 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 STK16O75716 305 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PPP3CCP48454 512 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RPP38P78345 283 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ARHGEF7Q14155 803 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 DEPDC1Q5TB30 811 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 OR4F3Q6IEY1 312 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 CHST9Q7L1S5 443 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 HTRA1Q92743 480 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 DNASE1L2Q92874 299 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 TESCQ96BS2 214 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PITX2Q99697 317 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ASB8Q9H765 288 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 CPNE5Q9HCH3 593 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PRDM8Q9NQV8 689 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PTPRSQ13332 1948 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 E9PQ18 207 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KRT6AP02538 564 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KRT6BP04259 564 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SERPINB1P30740 379 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KRT6CP48668 564 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 COLEC12Q5KU26 742 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 HORMAD1Q86X24 394 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ZZZ3Q8IYH5 903 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ENTHD1Q8IYW4 607 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ELMOD1Q8N336 334 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SLC38A4Q969I6 547 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 HHIPQ96QV1 700 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 IL21Q9HBE4 155 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ANKHQ9HCJ1 492 aa23.93■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 NFATC2Q13469 925 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ATG16L2Q8NAA4 619 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 SELENOMQ8WWX9 145 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 BHMTQ93088 406 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ITPAQ9BY32 194 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KIF17Q9P2E2 1029 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa23.92■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 METTL15A6NJ78 407 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 A8MU76 341 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 TBL1XO60907 577 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 LILRB3O75022 631 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 FGF18O76093 207 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KCNK5O95279 499 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PRPS2P11908 318 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 NPRL3Q12980 569 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 VMACQ2NL98 169 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ZNF404Q494X3 552 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 FAHD1Q6P587 224 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 PGBD3Q8N328 593 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 HSH2DQ96JZ2 352 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 ABCG8Q9H221 673 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 RDH14Q9HBH5 336 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 M0R082 166 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 KDELR2P33947 212 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 GSSP48637 474 aa23.91■■□□□ 1.42
LMO2-201ENST00000257818 CYP4F8P98187 520 aa23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms