RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC74AQ0VAA2 488 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGAP19Q14CB8 494 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DUOXA1Q1HG43 343 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FGF14Q92915 247 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CXorf40BQ96DE9 158 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CNBD2Q96M20 576 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 IKZF5Q9H5V7 419 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FBRSQ9HAH7 460 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF639Q9UID6 485 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DOCK8Q8NF50 2099 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 SOCS2O14508 198 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PCCBP05166 539 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 GZMMP51124 257 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CHRNB3Q05901 458 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 UGT8Q16880 541 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 LCTLQ6UWM7 567 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CARM1Q86X55 608 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 EGLN2Q96KS0 407 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 HAUS8Q9BT25 410 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ANKRD60Q9BZ19 345 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 S1PR5Q9H228 398 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ASF1AQ9Y294 204 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 TPST1O60507 370 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PCDH8O95206 1070 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ERGP11308 486 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PCNAP12004 261 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ADAM15Q13444 863 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 STARD3Q14849 445 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 NXPE4Q6UWF7 544 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 MTSS1LQ765P7 747 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 RNF175Q8N4F7 328 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 HDDC3Q8N4P3 179 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CBR4Q8N4T8 237 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FAM131CQ96AQ9 280 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 EBPLQ9BY08 206 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 OLAHQ9NV23 265 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 PADI4Q9UM07 663 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 GMEB1Q9Y692 573 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD9-201ENST00000249499 CKAP5Q14008 2032 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SAC3D1A6NKF1 404 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 CXCR6O00574 342 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 KMOO15229 486 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 ACOX3O15254 700 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PRSS23O95084 383 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 TRIM23P36406 574 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PIK3CBP42338 1070 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PHEXP78562 749 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 GTDC1Q4AE62 458 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 METRNLQ641Q3 311 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 OR4F3Q6IEY1 312 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 FIG4Q92562 907 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 RNF145Q96MT1 663 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 ARHGAP10A1A4S6 786 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 PIPSLA2A3N6 862 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 EVPLLA8MZ36 301 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SCN2BO60939 215 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 LRATO95237 230 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 COX7A2P14406 83 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 RAE1P78406 368 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 GCNT7Q6ZNI0 430 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SERPINA11Q86U17 422 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 TFAP2CQ92754 450 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SEPHS2Q99611 448 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 CENPKQ9BS16 269 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 INPP5KQ9BT40 448 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 MAGIXQ9H6Y5 334 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A13Q9NSD5 602 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 OAZ3Q9UMX2 235 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 CROCCQ5TZA2 2017 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 FAM149AA5PLN7 773 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 ANTXRLA6NF34 631 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 CLOCKO15516 846 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 ETHE1O95571 254 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD9-201ENST00000249499 HPCAL1P37235 193 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms