RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 PTNP21246 168 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 DNAJB1P25685 340 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ADRA1BP35368 520 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RAB14P61106 215 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GPR50Q13585 617 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SYT14Q8NB59 555 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ASB15Q8WXK1 588 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SLC22A4Q9H015 551 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 FAM227AF5H4B4 570 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 AREL1O15033 823 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 AKT1P31749 480 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 GPC1P35052 558 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MATKP42679 507 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 KIR2DL3P43628 341 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 LILRA4P59901 499 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 CCL15Q16663 113 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 PARP15Q460N3 678 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 LRRC66Q68CR7 880 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 C22orf42Q6IC83 251 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 OVOS1Q6IE37 1185 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SH3KBP1Q96B97 665 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 INPP5KQ9BT40 448 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 MROH8Q9H579 483 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 RNF121Q9H920 327 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.58□□□□□ -0.07
HOXC12-201ENST00000243103 OR2A25A4D2G3 310 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GLAP06280 429 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GJA1P17302 382 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DUSP7Q16829 419 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 AKIRIN2Q53H80 203 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 BCL2L15Q5TBC7 163 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RELTQ969Z4 430 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SENP8Q96LD8 212 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GPR21Q99679 349 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MGLLQ99685 303 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 AIFM2Q9BRQ8 373 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 A0A0B4J293 547 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 LINC01387J3KSC0 135 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TPST2O60704 377 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ECI2O75521 394 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TAF6P49848 677 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MAP2K6P52564 334 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C5orf22Q49AR2 442 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RIMKLAQ8IXN7 391 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RNF175Q8N4F7 328 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ULK4Q96C45 1275 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RNF31Q96EP0 1072 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 NTMT1Q9BV86 223 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 EBPLQ9BY08 206 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 USP3Q9Y6I4 520 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DPYSL4O14531 572 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GLUD1P00367 558 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 APOC3P02656 99 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 HLA-DQB2P05538 268 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PKLRP30613 574 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 DDOSTP39656 456 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 RCAN2Q14206 197 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 OR6K2Q8NGY2 324 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 SEC22CQ9BRL7 303 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 TINF2Q9BSI4 451 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 MKLN1Q9UL63 735 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 B4DXG7 233 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 PIP5K1CO60331 668 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXC12-201ENST00000243103 GGT1P19440 569 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms