RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 ABATP80404 500 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 NR1D2Q14995 579 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PROX2Q3B8N5 592 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PERM1Q5SV97 790 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FAM129CQ86XR2 697 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FAR2Q96K12 515 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DPH7Q9BTV6 452 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SLC29A3Q9BZD2 475 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ABCG4Q9H172 646 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 VTI1BQ9UEU0 232 aa22.11■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 B4GAT1O43505 415 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GPR3P46089 330 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 LSSP48449 732 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CCR8P51685 355 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CSNK1G2P78368 415 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DAB2P98082 770 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 AMZ1Q400G9 498 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SGO1Q5FBB7 561 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 IRGCQ6NXR0 463 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PIGWQ7Z7B1 504 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DDIASQ8IXT1 998 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EBF4Q9BQW3 602 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 TMEM9BQ9NQ34 198 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 POMT2Q9UKY4 750 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 MANBAO00462 879 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FLRT2O43155 660 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CHEK2O96017 543 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PVRP15151 417 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 MAGP20916 626 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GRIA3P42263 894 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SLC5A12Q1EHB4 618 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SPRED1Q7Z699 444 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PLD3Q8IV08 490 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 OR4K1Q8NGD4 311 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 C10orf82Q8WW14 230 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 NCSTNQ92542 709 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FEZF1A0PJY2 475 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DIAPH2O60879 1101 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 LRP3O75074 770 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 LINC00032P0C843 101 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CKMT1AP12532 417 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 TGM1P22735 817 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 NEK2P51955 445 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GFERP55789 205 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 REEP5Q00765 189 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 NHLH1Q02575 133 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 INAVAQ3KP66 663 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 MED27Q6P2C8 311 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 EPGNQ6UW88 154 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 RNF175Q8N4F7 328 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 C19orf60Q96EN9 201 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 C3orf30Q96M34 536 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ZMYND15Q9H091 742 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ELOVL6Q9H5J4 265 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SNX6Q9UNH7 406 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 SPEGQ15772 3267 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 A0A0J9YY10 115 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 H0YIV9 168 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 DUX1O43812 170 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PDYNP01213 254 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 KRT6AP02538 564 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 KRT6BP04259 564 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PCNAP12004 261 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 CD59P13987 128 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 PNLIPP16233 465 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 KRT6CP48668 564 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 IDH3AP50213 366 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ARFIP2P53365 341 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 LAPTM5Q13571 262 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 FRG2Q64ET8 278 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-201ENST00000222305 ZNF425Q6IV72 752 aa22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms