RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM159	Q96B96	161 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC138	Q96M89	665 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MYOC	Q99972	504 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	LHPP	Q9H008	270 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TDP1	Q9NUW8	608 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf18	Q9UK00	162 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.69	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	YY2	O15391	372 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAN1A2	O60476	641 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP9	O95302	570 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ETHE1	O95571	254 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SLC16A8	O95907	504 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FTH1	P02794	183 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CTSL	P07711	333 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CLTB	P09497	229 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MPC1L	P0DKB6	136 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	LAMP1	P11279	417 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PDHA2	P29803	388 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TTK	P33981	857 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CASP9	P55211	416 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GRIN2C	Q14957	1233 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	XAF1	Q6GPH4	301 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NELL1	Q92832	810 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CEP44	Q9C0F1	390 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT8	Q9NY28	637 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WNT9A	O14904	365 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	XPNPEP2	O43895	674 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NTRK1	P04629	796 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PRPS1L1	P21108	318 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	AQP1	P29972	269 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	VIPR1	P32241	457 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CEP68	Q76N32	757 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SNX19	Q92543	992 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO10	Q9UK96	956 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		12.68	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152		A0A0J9YVX5	310 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEB3	O15480	346 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ABCB7	O75027	752 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	EPN2	O95208	641 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TIMP2	P16035	220 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	IL5RA	Q01344	420 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SP140	Q13342	867 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SPART	Q8N0X7	666 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	OR4K3	Q96R72	315 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	SGK2	Q9HBY8	427 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CCNDBP1	O95273	360 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	CPNE6	O95741	557 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	GBA	P04062	536 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HTR1A	P08908	422 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT7	P0C024	238 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF30	P17039	623 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MAGEA8	P43361	318 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	RAPSN	Q13702	412 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	MYBPC3	Q14896	1274 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ACOX1	Q15067	660 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	HKDC1	Q2TB90	917 aa		12.67	□□□□□ -0.38
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF284	Q2VY69	593 aa		12.67	□□□□□ -0.38

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