RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	PAPLN	O95428	1278 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	WEE1	P30291	646 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TTPA	P49638	278 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ISL1	P61371	349 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VBP1	P61758	197 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHRNB3	Q05901	458 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NFYC	Q13952	458 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ACAP2	Q15057	778 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NPTX1	Q15818	432 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CARD16	Q5EG05	197 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	XKRX	Q6PP77	449 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PIK3R3	Q92569	461 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC32	Q9BV29	185 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IL1RL2	Q9HB29	575 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		14.89	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	METTL15	A6NJ78	407 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659		A8MT66	165 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EED	O75530	441 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FMO4	P31512	558 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HNF1B	P35680	557 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ETV6	P41212	452 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PPP2R2B	Q00005	443 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GALK2	Q01415	458 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAD51	Q06609	339 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PIM3	Q86V86	326 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	METTL4	Q8N3J2	472 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NAT16	Q8N8M0	369 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EID2B	Q96D98	161 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MBOAT4	Q96T53	435 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ERVW-1	Q9UQF0	538 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BNIP3L	O60238	219 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRKD3	O94806	890 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RHOBTB1	O94844	696 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FGF4	P08620	206 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ITGAM	P11215	1152 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LBP	P18428	481 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNK10	P57789	538 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CACNG1	Q06432	222 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RPS6KA2	Q15349	733 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DHCR24	Q15392	516 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VOPP1	Q96AW1	172 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TMCO6	Q96DC7	493 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	COQ7	Q99807	217 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DUSP21	Q9H596	190 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	14.88	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SNX2	O60749	519 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PCNA	P12004	261 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NFKB2	Q00653	900 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	STARD3	Q14849	445 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CLCA4	Q14CN2	919 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CDKN3	Q16667	212 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		14.87	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		14.87	□□□□□ -0.03

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