RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3AQ14563 771 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA25Q14CX7 972 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 FOPNLQ96NB1 174 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 DPH7Q9BTV6 452 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 STMN3Q9NZ72 180 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK4Q9Y5K2 254 aa26■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP9Q99996 3911 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PKDREJQ9NTG1 2253 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YGG7 62 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS26AO75436 327 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf105O95561 183 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ICAM2P13598 275 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF10P55107 478 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PCOLCEQ15113 449 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PRTGQ2VWP7 1150 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF534Q76KX8 674 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1A1LQ8N752 337 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PQ72 361 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MUI8 341 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf84I3L1E1 186 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF766Q5HY98 468 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 PANX3Q96QZ0 392 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM121Q9BTD3 319 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF700Q9H0M5 742 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MKL2Q9ULH7 1088 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A25A4D2G3 310 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 RCCD1A6NED2 376 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN14O95500 239 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNFP41002 786 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOAQ7RTW8 1153 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH24Q86UP0 819 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP97Q8IW35 865 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 AMER2Q8N7J2 671 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG3Q92685 438 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MVB12AQ96EY5 273 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF778Q96MU6 729 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB6Q9BUF5 446 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CATSPERZQ9NTU4 200 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPTGQ9UJJ9 305 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP20933 346 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRA1DP25100 572 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 YBX1P67809 324 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 HKDC1Q2TB90 917 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO42Q6P3S6 717 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 AMER3Q8N944 861 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGCLL1Q8TB92 370 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL21AQ8WXB1 218 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 HIVEP1P15822 2718 aa25.95■■□□□ 1.75
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PPV9 198 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 E7EVH7 732 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 I3L1I5 382 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TTI1O43156 1089 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 WISP2O76076 250 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MLYCDO95822 493 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EMP3P54852 163 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-9P60411 292 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SYT16Q17RD7 645 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MFSD4BQ5TF39 518 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GPAMQ9HCL2 828 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KPNA5O15131 536 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A3P40879 764 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TTPAP49638 278 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FCRLBQ6BAA4 426 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC8BQ6P9F7 803 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DRC3Q9H069 523 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL1Q9NR64 748 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TCAF1Q9Y4C2 921 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0U1RQJ8 604 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPN3P20807 821 aa25.93■■□□□ 1.74
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