RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FANCC	Q00597	558 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PGGHG	Q32M88	737 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	P3H1	Q32P28	736 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MSS51	Q4VC12	460 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	UBA3	Q8TBC4	463 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A28	Q96A46	364 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NTAN1	Q96AB6	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ABCG8	Q9H221	673 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CUTC	Q9NTM9	273 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LRP5L	A4QPB2	252 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6AP2	O75787	350 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	VNN1	O95497	513 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TUBB4A	P04350	444 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	F13B	P05160	661 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFAIP3	P21580	790 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR7	P34969	479 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKCI	P41743	596 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PDK1	Q15118	436 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RPE65	Q16518	533 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	QPCT	Q16769	361 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATC1	Q76KD6	591 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	DTX2	Q86UW9	622 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM251	Q8N6I4	163 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4F5	Q8NH21	305 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	STRA6	Q9BX79	667 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LNPK	Q9C0E8	428 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LHX3	Q9UBR4	397 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	GLS2	Q9UI32	602 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PACSIN3	Q9UKS6	424 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	5.73	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	PINLYP	A6NC86	204 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FRG2C	A6NGY1	282 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CD8B2	A6NJW9	211 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	C16orf97	H3BN30	126 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	KMO	O15229	486 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ST8SIA5	O15466	376 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	XPNPEP2	O43895	674 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CDC45	O75419	566 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CELA3A	P09093	270 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	POU2F1	P14859	743 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SELE	P16581	610 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	VCL	P18206	1134 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LHCGR	P22888	699 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FPR2	P25090	351 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	MMP16	P51512	607 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	AP3M2	P53677	418 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	BCL2L1	Q07817	233 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXF2	Q12947	444 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	XRCC4	Q13426	336 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RUNX2	Q13950	521 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SEMA3A	Q14563	771 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC10A1	Q14973	349 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	EXT1	Q16394	746 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HYI	Q5T013	277 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TTI2	Q6NXR4	508 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	SHC4	Q6S5L8	630 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	BEND5	Q7L4P6	421 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB3IL1	Q8TBN0	382 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	HPS1	Q92902	700 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TP53INP1	Q96A56	240 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2AG1	Q9H205	316 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SNAP23-223	ENST00000627440	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		5.72	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms