RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR2M7Q8NG81 312 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR13F1Q8NGS4 319 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SPATA22Q8NHS9 363 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF566Q969W8 418 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHDC7BQ96G42 594 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HSPA12BQ96MM6 686 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 OR6C1Q96RD1 312 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PSD2Q9BQI7 771 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MYL10Q9BUA6 226 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GPR62Q9BZJ7 368 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MTRRQ9UBK8 725 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 UBQLN2Q9UHD9 624 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CDC14AQ9UNH5 594 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 COPS3Q9UNS2 423 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HIF3AQ9Y2N7 669 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TCRBV5S2A0A599 114 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM205CA6NFA0 338 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MROH6A6NGR9 719 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM150CB9EJG8 249 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GPR182O15218 404 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NCK2O43639 380 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TPPPO94811 219 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MBD4O95243 580 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NDUFA10O95299 355 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CELF2O95319 508 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NSA2O95478 260 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 IFNW1P05000 195 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PAEPP09466 180 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 THEGLP0DJG4 465 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CKMT1AP12532 417 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PSMA2P25787 234 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACTR1BP42025 376 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ACLYP53396 1101 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 RRADP55042 308 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KCNQ4P56696 695 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 GNG11P61952 73 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ABRAXAS2Q15018 415 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 P2RY14Q15391 338 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TGFBIQ15582 683 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DGKDQ16760 1214 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 QRICH1Q2TAL8 776 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHL38Q2WGJ6 581 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF385BQ569K4 471 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 USP45Q70EL2 814 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 DEFB128Q7Z7B8 93 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 COMTD1Q86VU5 262 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SPPL2CQ8IUH8 684 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF276Q8N554 614 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CERS5Q8N5B7 392 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZFP41Q8N8Y5 198 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 NT5C3BQ969T7 300 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZDHHC12Q96GR4 267 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SGSM3Q96HU1 749 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CEP170P1Q96L14 293 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SPATA33Q96N06 139 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SEPHS2Q99611 448 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 UGT2B28Q9BY64 529 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC19A3Q9BZV2 496 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ENKD1Q9H0I2 346 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 SH3BGRL3Q9H299 93 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CCSER2Q9H7U1 834 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 IL1RL2Q9HB29 575 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 BIN3Q9NQY0 253 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CMTM6Q9NX76 183 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PRXQ9BXM0 1461 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 HFM1A2PYH4 1435 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 CFTRP13569 1480 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 MAP3K5Q99683 1374 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 LCHNA4D1U4 455 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 PSCAO43653 123 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRQ-209ENST00000616559 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms