RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 NAT9Q9BTE0 207 aa20.23■□□□□ 0.83
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SLC25A39-216ENST00000592857 CRYMQ14894 314 aa20.19■□□□□ 0.82
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SLC25A39-216ENST00000592857 TMBIM4Q9HC24 238 aa20.19■□□□□ 0.82
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