RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587465.6

TNNT1-208, Transcript of troponin T1, slow skeletal type, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT1, Length 1,065 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNNT1-208	ENST00000587465	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PRR7	Q8TB68	274 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	TCF12	Q99081	682 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	GPR21	Q99679	349 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CRB3	Q9BUF7	120 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		18.51	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CTAGE9	A4FU28	777 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	KLHL18	O94889	574 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CBX6	O95503	412 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CELA2A	P08217	269 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CMPK1	P30085	196 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PNLIPRP1	P54315	467 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CYP1B1	Q16678	543 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ICE2	Q659A1	982 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	HPS6	Q86YV9	775 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CPNE9	Q8IYJ1	553 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	IQCK	Q8N0W5	287 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CD200R1	Q8TD46	325 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SMPDL3A	Q92484	453 aa		18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	NOTCH2	Q04721	2471 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465		E7ENX8	843 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465		H3BMM5	538 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	HAT1	O14929	419 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	HAUS5	O94927	633 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	FKBP9	O95302	570 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	TAP2	Q03519	686 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SLC35F6	Q8N357	371 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	AMER3	Q8N944	861 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MCU	Q8NE86	351 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CABS1	Q96KC9	395 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	OR2A5	Q96R48	311 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	NDN	Q99608	321 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	C3orf18	Q9UK00	162 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		18.49	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SMAP	O00193	183 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	FOXS1	O43638	330 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ALPP	P05187	535 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CD63	P08962	238 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PAM	P19021	973 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	COL8A1	P27658	744 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	IMPA1	P29218	277 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	GLRB	P48167	497 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MSS51	Q4VC12	460 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	ASB11	Q8WXH4	323 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		18.48	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	MLN	P12872	115 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	GABRB3	P28472	473 aa		18.47	■□□□□ 0.55
TNNT1-208	ENST00000587465	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms