RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 SLC1A6P48664 564 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CCNG1P51959 295 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ABATP80404 500 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 GUCY1A3Q02108 690 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 IRF8Q02556 426 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CFHR1Q03591 330 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 XKR6Q5GH73 641 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 IRGCQ6NXR0 463 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 NEIL2Q969S2 332 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TGM7Q96PF1 710 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 OR2A14Q96R47 310 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ZNF382Q96SR6 550 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CD180Q99467 661 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 DRC3Q9H069 523 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 EHD1Q9H4M9 534 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ACTR8Q9H981 624 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ZBTB26Q9HCK0 441 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 EPHA6Q9UF33 1036 aa6.45□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 POMT2Q9UKY4 750 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 D6RAR5 112 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 H7BY64 318 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PPP6CO00743 305 aa6.44□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ITM2AO43736 263 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 UGDHO60701 494 aa6.44□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 CSO75390 466 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CRCPO75575 148 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 RASSF9O75901 435 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CLDN9O95484 217 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 ESRRBO95718 433 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CPNE6O95741 557 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CHRNGP07510 517 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 EBLN1P0CF75 366 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CDH1P12830 882 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 JUPP14923 745 aa6.44□□□□□ -1.38
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PRPF8-210ENST00000574217 PDX1P52945 283 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 GYS2P54840 703 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PKNOX1P55347 436 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 GFERP55789 205 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1CAP62136 330 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 SH3BP2P78314 561 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 PCDH1Q08174 1060 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TRAF3Q13114 568 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CHIT1Q13231 466 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 SQSTM1Q13501 440 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TBCCQ15814 346 aa6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PRPF8-210ENST00000574217 TUBB8Q3ZCM7 444 aa6.44□□□□□ -1.38
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