RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPATCH11Q8N954 259 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHACTR1Q9C0D0 580 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB17Q9H0T7 212 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ING2Q9H160 280 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC26A1Q9H2B4 701 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACSS2Q9NR19 701 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TLK1Q9UKI8 766 aa16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCM1Q15154 2024 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0J9YVX5 310 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYSRT1A8MQ03 144 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TXNDC9O14530 226 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAD51CO43502 376 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST1H2ADP20671 130 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 AP1S2P56377 157 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUM1Q2TAK8 710 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DUPD1Q68J44 220 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAQR7Q86WK9 346 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZBED8Q8IZ13 594 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PYROXD1Q8WU10 500 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTERQ96BW5 349 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINGO1Q96FE5 620 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDE10AQ9Y233 779 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 BSNQ9UPA5 3926 aa16.35■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 NAV2Q8IVL1 2488 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HYKKA2RU49 373 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARGFXA6NJG6 315 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSPAN12O95859 305 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf54Q08AI8 447 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYS1Q717R9 158 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD7Q92527 254 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MVB12AQ96EY5 273 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPH5Q9H2P9 285 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC17A6Q9P2U8 582 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa16.34■□□□□ 0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEX12O00623 359 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.33■□□□□ 0.25e-6■□□□□ 8.1
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEACAM4O75871 244 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GSTA2P09210 222 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ITGAXP20702 1163 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBPL1P62380 186 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRB1Q12918 225 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPZQ66K79 652 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 STRA8Q7Z7C7 330 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRGPREQ86SM8 312 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 HPS6Q86YV9 775 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR4N4Q8N0Y3 316 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATL1Q8WXF7 558 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDKL2Q92772 493 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS39Q96JC1 886 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.33■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0YGG7 62 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRP2O60462 931 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHL41O60662 606 aa16.32■□□□□ 0.2
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJB5O75953 348 aa16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms