RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 HEXAP06865 529 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ALPIP09923 528 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PLA2G4BP0C869 781 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM225BP0DP42 221 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RRASP10301 218 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MYL6BP14649 208 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CPA3P15088 417 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF44P15621 663 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DNASE1P24855 282 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ITGB8P26012 769 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DLSTP36957 453 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEA9P43362 315 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 IER3P46695 156 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FMO5P49326 533 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CCT3P49368 545 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 BCAP31P51572 246 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGDIAP52565 204 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CACNA2D1P54289 1103 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 C21orf59P57076 290 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TAS2R50P59544 299 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PTENP60484 403 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RPS15P62841 145 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PIGFQ07326 219 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FADDQ13158 208 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TNK1Q13470 666 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TP53BP2Q13625 1128 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HERC3Q15034 1050 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PARP6Q2NL67 630 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 POM121L1PQ3SYA9 428 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GXYLT1Q4G148 440 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SMUG1Q53HV7 270 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PDZK1Q5T2W1 519 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RAET1LQ5VY80 246 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC66Q68CR7 880 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC27Q6P3X3 843 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 COLCA1Q6ZS62 124 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TRILQ7L0X0 811 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LRRC6Q86X45 466 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF280BQ86YH2 543 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CNGA4Q8IV77 575 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NUDCD3Q8IVD9 361 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MICU2Q8IYU8 434 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 LSMEM2Q8N112 164 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NPIPB3Q92617 1050 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SH3GL3Q99963 347 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ACBD6Q9BR61 282 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NDC1Q9BTX1 674 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 IL22Q9GZX6 179 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ACTR8Q9H981 624 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SGK2Q9HBY8 427 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PDGFCQ9NRA1 345 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PTGFRNQ9P2B2 879 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 CTSFQ9UBX1 484 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SERGEFQ9UGK8 458 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FZD10Q9ULW2 581 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 FAM96BQ9Y3D0 163 aa3.42□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 A0A1W2PR77 199 aa3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM120BA0PK00 339 aa3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF35A5YM69 484 aa3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.41□□□□□ -1.86
SYF2P1-201ENST00000550658 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms