RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 TXNDC9O14530 226 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TRIM13O60858 407 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TSPAN12O95859 305 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OTCP00480 354 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 NR1D1P20393 614 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GRK2P25098 689 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CCR8P51685 355 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CCNG1P51959 295 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OR1D5P58170 312 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 HERVK_113P63132 956 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PPP2R2AP63151 447 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PHF19Q5T6S3 580 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM164Q5U3C3 297 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CACHD1Q5VU97 1274 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 LIPMQ5VYY2 423 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GUSBP11Q6P575 273 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM71Q6P5X7 295 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SBSNQ6UWP8 590 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZYG11AQ6WRX3 759 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SPRED1Q7Z699 444 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CLEC14AQ86T13 490 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EXOC3L1Q86VI1 746 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 KMT5CQ86Y97 462 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CYP4X1Q8N118 509 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TTLQ8NG68 377 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 HMGCLL1Q8TB92 370 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PATE1Q8WXA2 126 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZUFSPQ96AP4 578 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PHF21BQ96EK2 531 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TGM7Q96PF1 710 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TRMOQ9BU70 441 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ERVK-6Q9BXR3 956 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CD244Q9BZW8 370 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 RAB33BQ9H082 229 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PDE7BQ9NP56 450 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 NMRK1Q9NWW6 199 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.3□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 LRP4O75096 1905 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 A0A0J9YY10 115 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 URADA6NGE7 173 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TERTO14746 1132 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PPM1DO15297 605 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 PLIN3O60664 434 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SUPT7LO94864 414 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 EML2O95834 649 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MYF5P13349 255 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 IMPDH1P20839 514 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SERPINB1P30740 379 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TBPL1P62380 186 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 NFKB2Q00653 900 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 IRF8Q02556 426 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TGM3Q08188 693 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 VAC14Q08AM6 782 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 CDC16Q13042 620 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 NR1D2Q14995 579 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SETDB1Q15047 1291 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OR4D1Q15615 310 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SNAP47Q5SQN1 464 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 SPESP1Q6UW49 350 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 LCTLQ6UWM7 567 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 ATG14Q6ZNE5 492 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 GPR135Q8IZ08 494 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 TEX9Q8N6V9 391 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.29□□□□□ -0.92
CS-218ENST00000550159 MGARPQ8TDB4 240 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms