RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SPATA20	Q8TB22	786 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FIG4	Q92562	907 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TANK	Q92844	425 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RIT1	Q92963	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PHF21A	Q96BD5	680 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LILRA5	A6NI73	299 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DUXA	A6NLW8	204 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZBTB14	O43829	449 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LDB3	O75112	727 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PGLS	O95336	258 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LINC00271	P0C7V0	271 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SNHG28	P0DPA3	235 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	UROS	P10746	265 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ACP2	P11117	423 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ITGA2	P17301	1181 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SOAT1	P35610	550 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PSMC4	P43686	418 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RGS7	P49802	495 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KHK	P50053	298 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PLCD1	P51178	756 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP15	P51511	669 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MTCP1	P56278	107 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GSDMD	P57764	484 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	DLK1	P80370	383 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC20A2	Q08357	652 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CBX3	Q13185	183 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CUL3	Q13618	768 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF234	Q14588	700 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NFATC4	Q14934	902 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PARP10	Q53GL7	1025 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KLC3	Q6P597	504 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NOTUM	Q6P988	496 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CNST	Q6PJW8	725 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	APCDD1	Q8J025	514 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	BMPER	Q8N8U9	685 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF114	Q8NC26	417 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ASB5	Q8WWX0	329 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CAPNS2	Q96L46	248 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM237	Q96Q45	408 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	THAP9	Q9H5L6	903 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	VPS18	Q9P253	973 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	RTL1	A6NKG5	1358 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	CKAP5	Q14008	2032 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PPIP5K2	O43314	1243 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	VEGFD	O43915	354 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	PRAF2	O60831	178 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	KCNJ13	O60928	360 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	WDR1	O75083	606 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	AKAP3	O75969	853 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	GSR	P00390	522 aa		3.85	□□□□□ -1.79
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINB2	P05120	415 aa		3.85	□□□□□ -1.79

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