RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 C16orf70Q9BSU1 422 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 IKZF5Q9H5V7 419 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 BRF2Q9HAW0 419 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PKD2L2Q9NZM6 624 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRODH2Q9UF12 536 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 DAPK2Q9UIK4 370 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MKLN1Q9UL63 735 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSF4Q9ULV5 492 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MMACHCQ9Y4U1 282 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 R4GN57 208 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.45□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 CUL9Q8IWT3 2517 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MYO16Q9Y6X6 1858 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM8BA6NDV4 472 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 EPOPA6NHQ4 379 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FPGTO14772 594 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 LDLRAD4O15165 306 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF861PO60384 105 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSG2P11465 335 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FASP25445 335 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC1A4P43007 532 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PAFAH1B1P43034 410 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 BRCC3P46736 316 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR3A2P47893 321 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 RARSP54136 660 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FUT7Q11130 342 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TAF10Q12962 218 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PSG7Q13046 419 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRMP1Q14194 572 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 POSTNQ15063 836 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRAMD1BQ3KR37 738 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ALDH1L2Q3SY69 923 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GRTP1Q5TC63 336 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 IGFL1Q6UW32 110 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMTC3Q6ZXV5 915 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FCRLAQ7L513 359 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 NAXDQ8IW45 347 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM61Q8N0U2 210 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF491Q8N8L2 437 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR7A2PQ8NGA2 310 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR11H4Q8NGC9 324 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GANCQ8TET4 914 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 EXOC4Q96A65 974 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM218AQ96MZ4 157 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRB3Q9BUF7 120 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 INPP5EQ9NRR6 644 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 NECAP2Q9NVZ3 263 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRANK1O15050 2925 aa0.44□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 A0A1W2PRG0 241 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FRG2CA6NGY1 282 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF749O43361 778 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 SETSIPP0DME0 302 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 AADACP22760 399 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 NMBRP28336 390 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OAS2P29728 719 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MDH2P40926 338 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPR143P51810 404 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 KRT33BQ14525 404 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GPR68Q15743 365 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 CGB2Q6NT52 195 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPAINQ86UA6 219 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF786Q8N393 782 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 NME8Q8N427 588 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 RNF182Q8N6D2 247 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMEM116Q8NCL8 245 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR6T1Q8NGN1 323 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 OR6F1Q8NGZ6 308 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 GTSF1Q8WW33 167 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 SERINC2Q96SA4 455 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 RAD9AQ99638 391 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 PAXXQ9BUH6 204 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 FNDC11Q9BVV2 318 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 VCXQ9H320 206 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRPV4Q9HBA0 871 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 ABI3Q9P2A4 366 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa0.43□□□□□ -2.34
IGKV1-22-201ENST00000524313 STAB1Q9NY15 2570 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms