RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MFAP5Q13361 173 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 NAA25Q14CX7 972 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TLR1Q15399 786 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PRTGQ2VWP7 1150 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 ATG9BQ674R7 924 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CENPUQ71F23 418 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 COG1Q8WTW3 980 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PKP4Q99569 1192 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PLCD4Q9BRC7 762 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.12■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 FFAR3O14843 346 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 GPR42O15529 346 aa16.11■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 VPS41P49754 854 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 EMP3P54852 163 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 KCNJ11Q14654 390 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 HKDC1Q2TB90 917 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 NEPROQ6NW34 567 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CASC4Q6P4E1 433 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PAQR7Q86WK9 346 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CSNK1A1LQ8N752 337 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CATSPER1Q8NEC5 780 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 LMF1Q96S06 567 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 YIPF2Q9BWQ6 316 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TRPC4Q9UBN4 977 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TAC3Q9UHF0 121 aa16.11■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.11■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 E2F3O00716 465 aa16.1■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 PAMP19021 973 aa16.1■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 PNLIPRP1P54315 467 aa16.1■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 PPFIBP2Q8ND30 876 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 FAR1Q8WVX9 515 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 OR2A5Q96R48 311 aa16.1■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 HOMER3Q9NSC5 361 aa16.1■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 OSGIN2Q9Y236 505 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa16.1■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CTAGE9A4FU28 777 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 IDSB3KWA1 339 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 USP1O94782 785 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 SLC16A8O95907 504 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 CCDC175P0C221 793 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 EDN3P14138 238 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B2P37059 387 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 MAGEA6P43360 314 aa16.09■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 PSMF1Q92530 271 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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HERC3-211ENST00000513325 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 PTGFRNQ9P2B2 879 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa16.09■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 NOTCH2Q04721 2471 aa16.08■□□□□ 0.17
HERC3-211ENST00000513325 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
HERC3-211ENST00000513325 E7ENX8 843 aa16.08■□□□□ 0.16
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