RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WWP1	Q9H0M0	922 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	THAP2	Q9H0W7	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DEF6	Q9H4E7	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DTL	Q9NZJ0	730 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POMT2	Q9UKY4	750 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		A0A1W2PQJ5	194 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DYTN	A2CJ06	578 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPR39	O43194	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DLX3	O60479	287 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZG16	O60844	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF205	O95201	554 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SERPING1	P05155	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MMP2	P08253	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GSTM1	P09488	218 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RNF224	P0DH78	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SKIL	P12757	684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	COX6B1	P14854	86 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITGAL	P20701	1170 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SHMT2	P34897	504 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RORA	P35398	523 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PTGER4	P35408	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	NR2C2	P49116	596 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LMAN1	P49257	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HMGA2	P52926	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARSF	P54793	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GFRA1	P56159	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GBE1	Q04446	702 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RBPJ	Q06330	500 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ABR	Q12979	859 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB17	Q13105	803 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TFDP2	Q14188	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPRC6A	Q5T6X5	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		Q6ZS92	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CNTD1	Q8N815	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAM71B	Q8TC56	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HM13	Q8TCT9	377 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GRHL3	Q8TE85	626 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	SCYL1	Q96KG9	808 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RNF157	Q96PX1	679 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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